Корпус — сердце модульных стереомикроскопов. Он содержит объективы и призмы, которые захватывают изображение препарата, увеличивают его и направляют в окуляры. Отдельно корпус микроскопа нельзя использовать для наблюдения объекта, требуются окуляры для увеличения изображения и штатив с механизмом для подъема и опускания корпуса для фокусировки препарата. Стереомикроскопы с фиксированным увеличением имеют одну пару объективов. Для изменения общего увеличения можно использовать окуляры с различным увеличением.